Details for gene: SDHD


This gene encodes a member of complex II of the respiratory chain, which is responsible for the oxidation of succinate. The encoded protein is one of two integral membrane proteins anchoring the complex to the matrix side of the mitochondrial inner membrane. Mutations in this gene are associated with the formation of tumors, including hereditary paraganglioma. Transmission of disease occurs almost exclusively through the paternal allele, suggesting that this locus may be maternally imprinted. There are pseudogenes for this gene on chromosomes 1, 2, 3, 7, and 18. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Feb 2013]


Symbol
SDHD
Name
succinate dehydrogenase complex subunit D
Entrez ID
6392
Ensembl ID
ENSG00000204370    (more details)
KEGG ID
hsa:6392    (more details)
OMIM ID
619167
Uniprot ID
O14521  
GO ID
hsa:6392    (more details)
Chromosome
11
Strand
1
Start
112086824
End
112120016
miRNA Interactions
hsa-miR-124-3p (RPM: 4110.4386) / hsa-miR-182-5p (RPM: 77446.6216) / hsa-miR-1303 (RPM: 5.3758) / hsa-miR-147a (RPM: 0.0014) / hsa-miR-374a-5p (RPM: 52.6724) / hsa-miR-5006-3p (RPM: 0.4468) / hsa-miR-369-3p (RPM: 7.3414) / hsa-miR-488-3p (RPM: 11.3394) / hsa-miR-3138 (RPM: 0.07) / hsa-miR-610 (RPM: 0.032) / hsa-miR-374b-5p (RPM: 72.7188) / hsa-miR-130a-5p (RPM: 1.1956) / hsa-miR-5680 (RPM: 0.2512) / hsa-miR-204-5p (RPM: 265062.0076) / hsa-miR-5571-3p (RPM: 0.0016) / hsa-miR-23b-3p (RPM: 2125.0486) / hsa-miR-23a-3p (RPM: 613.2568) / hsa-miR-130b-5p (RPM: 60.0122) / hsa-miR-4517 (RPM: 0.0368) / hsa-miR-23c (RPM: 1.4294) / hsa-miR-556-5p (RPM: 0.386) / hsa-miR-202-5p (RPM: 0.3964) / hsa-miR-3159 (RPM: 0.2288) / hsa-miR-384 (RPM: 0.015) / hsa-miR-210-3p (RPM: 361.0562) / hsa-miR-6875-3p (RPM: 0.0698) / hsa-miR-6833-5p (RPM: 0.0428) / hsa-miR-4800-5p (RPM: 0.0042) / hsa-miR-7975 (RPM: 0.0346) /
Involved Diseases
retinoblastoma /
Involved Pathways
Metabolic pathways / Carbon metabolism / Non-alcoholic fatty liver disease (NAFLD) / Alzheimer's disease / Parkinson's disease / Amyotrophic lateral sclerosis (ALS) / Huntington's disease / Prion diseases / Citrate cycle (TCA cycle) / Oxidative phosphorylation / Metabolism / The citric acid (TCA) cycle and respiratory electron transport / Respiratory electron transport, ATP synthesis by chemiosmotic coupling, and heat production by uncoupling proteins. / Respiratory electron transport / Citric acid cycle (TCA cycle) / Pyruvate metabolism and Citric Acid (TCA) cycle /
Sequence
CCTGTTTTCTTTCGTCGTCGTGGGTGGGAATTGTCGCCTAAGTGGTTCCGGGTTGGTGGATGACCTTGAGCCCTCAGGAACGAGATGGCGGTTCTCTGGAGGCTGAGTGCCGTTTGCGGTGCCCTAGGAGGCCGAGGTGAGGGGTCTTCCCACCCTGAGGTGCTTAGCGTAGCCTCCAGCCAGGGAAGGGGATGGAAGTGAGGACTCATCTGCCGGGTGGGAGATCTCTTGAGGAGAAGAAAATACCGAAATCACAGCAATGACCACTGTAGTCTAGGGGTCCAGATGTTTACCCGAAGGTATATTTCACTTGCTGTGAGCTGACGAGTTGAGGGAATAATCAGAAAGAGAGCTCCCTCTGGAAGTCGCAGTCCTGATGAGGCTAATCCACATAGCAGTTCTGTTTTCTCCCCGTTCACTGTCCCTAGAATGCTCCCCACTCGCTCCCACCCTGAGTCGGGAAAGAGGGTTAGGAGCTTGCCCATTTCTTCTGGAGTTGGTGTGTTTGGATGTGGGAGTGGAGGGGGGATCAGTTCGAAAATCATTTAACCTGGGCATTTGTGTTACCTCAGGTACTGTAGTAATGCTAGGATACAAATGTGAAGAAAACGTAGTTCCCGCCCTCAACGAGCTTTCATTCTGATGAGGAAAACACTGTCATAGTAGTCCGGGCAAGATGAGGTCCTGAACTAGGAAAGTAGCACAAAGAAAAGAAGATTGTCTCAAGAACTGTTAAAGAGATACGCCAATAGGATTTGGCGATTGAATTTAGGGGAAAAGTCTCTCATGATTTCCAGATTACTGAGTTAGGTTAAAGAATGCCTGAGGTGTCATTAAATAAAGTAGGGAACATGCAGATGTTCCCTGGTCTTAACTTCACAGTAACCCCAGTGAAATAGATGCTATCTTCATTTTACAAATAAGATGTTATCCCCTATTTATTGTTAAGTAGCTTACCTATGGTCATTTAGAAAGTTTGTCAGTCCTGTTAAAGGAGAGGTTCTTATGATCATCCTAATGACTCTTTCCTCAGCTCTGTTGCTTCGAACTCCAGTGGTCAGACCTGCTCATATCTCAGCATTTCTTCAGGACCGACCTATCCCAGAATGGTGTGGAGTGCAGCACATACACTTGTCACCGAGCCACCATTGTATGTTCTCTCCATCGCTGCTGCTTTCTGGGCTCTAGCCATCTTTACCTTCACTAATGGTCATGCCTTTAGCAGGACTTCCTACCTGTAGGGGGGACTCTTGTGTCCAACTTTGTCAAATGAAGACCTAGTTTACACCTTTGGGCAGACAGTGCCATTATGGTTGAATGATGCCATTTATAATCATAGAAGACCTTCTAGCCTAAGTCTTTACAAATTTTTTTCTTTTGTTTTCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTTATGCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCACCTTCTGAGTTCAAGCAATTCTCCTGCCCCTGCCTCCCGACTAGCTGGGATTACAGGCGCCCACCACCATGCCCAGCTAAGTTTTGTACTTTTAGTAGAGACGGGTTTCACCGTGTTGGCCGGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTGCAGGCGTGAGCCACCACGCCTGGACCACTAACTTACATTCATAAGGTGTCTGTTCACTTCACTGAACCAAGACTGGCTTAATTCTGTAGCAATACAGCAATTCTGTTTTTTATCCATCTTCTTGGATCTGTCTTCTAATCAATATGTAGGCATTGAGATACCCTTGTGCTAAAAGACTTCAAAAAACAGAGATAAAGCCTTCAAAAAACAGAGATAGCTTCTCTCAACTACTATTTTGATATTTTACTTCCTTTGTACTCAGAGTTATATCCTATATGTACACTGCCTGTCAGTTTGGGTTACTGTGTGGCATATGTTGAACATGAAAGATGTGTGTTTCTCACATCAACTTTTATGAATCTGGTCCTTTTTGTAGCTGGCTCCAAGGCTGCATCTCTCCACTGGACTAGCGAGAGGGTTGTCAGTGTTTTGCTCCTGGGTCTGCTTCCGGCTGCTTATTTGAATCCTTGCTCTGCGATGGACTATTCCCTGGCTGCAGCCCTCACTCTTCATGGTCACTGGCAAGTATAGCAATTCCAAATATAGTTGTCTGCTCAGTTTGTTTGCTGTGAGCTTGTCTTATGTATTATATATGAGGGAGAAGTTGATTGAAATGCCCTAAATTTGTTGAAAACTTTAAAATATATATAAAATATGTATATGCCTAGATTTATATATCTGCCTGCCTATTCAATGTCTTTCAATTCGATTTCCGTATCTAATAGCATTTTGAATGTAGCCTGTCAAACTGAATTTCTGATCTCCCCTAATCTGTTCCTCCTGCACTCTTGCCCCATCTGAATTAATGGCATTTCCAGTTTTCTCTTTGTTCAAGTCTAAACCTGGTAAGCTCCAAACTTGGTCATTATCCTTGACTCTAGTAGTAGTCTCCTAACTGGTTCCCATTTGTGTTCATTCCCAACACAGCATACCCAGTGATCCTGTTAAAATGTTAATTAGAATAAGACATTCCCCTTCTCAAAACCCTATTTTGTCTCTTCATGTTACTCAAAGTCAGAATTCTTAGGGTTGTCTGTAGACTCTACATGATTGAACCACCCTGTTTCTTCCCTCATTTTTAGCTGCTCTCTCTCTCATTCACACTGCCTTCCTTGAGATTCCTTGAACATGCCAGGGACATTCCAGGTCTCAGGGCTTCTCTTACTGCTTCTGCCTGAAACTCTTTTTCTAGCTATACACTTGGCTTGTTCCTTCATCTCCTTCAGGTCTTGAATGCCATTCTCTCAACAAAGCCTTCCCTAACCACTTATTCAAAATTGCAGTTTCTGTCCTGCCATTCCTTATCTCTCTTGCTTGTTTTATTTTTCTCAATAGTACTTACTGCCTTCTAATATACTACATCATCTGTTCATTATTTTATATAGTAATTGCTTCCTTGCATTTTATCACCCAAATGTATATCCCTAAATAGTATAGTTTATTCTTGCCTCTTAAAAAAAAAAAAGAGATGTATGTGGGTGGATTATTTTGTTATTTTTACTGTATTTGTTTGCTGTTGTGCCTCTAGAGCCTAGAACTACTCTCTGGTACGTGACATATAGCACTCAGTAAATACTTGCTGAATGAATGAGCATCCAGCGCCTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTATTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGTGATCTCAGCTCACCACAACCTCCGCCTCCCAGGTACAAGCGATTCTCCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCGTGCACCACCACATCCGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCGCCATTTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCGCTTCAGCCTCCTAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGTCCGGCCCAGCTTTTGTTTATTTTATCTGGTATAGTTTGTATGACTTTCTACGTAATGAACCTTCTAAAATGAGGGTAAATGACAGGTTGGGTTCCTTGAGTTGTTCTTTTTAAGTTTTGCAAGGGACAATATGTTGTCATTGTGGGGGGTAGGGAGCCACTTTCGGATTGTTGAAACTGGAAGTACTTTGGAGAGTATCTTAACCAACTCTTTTATTTTACAGATTTGGAAACTAAGACCCAGGGAGGTTAAGTGACTTGTCAGAATCATTTTCTAGCTAGTGTTAAAGATTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTGGGACGGAGTCTCACTCTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGGTTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGCCTCAGCCTCCCAAGCAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCAGCACACCTGGCTCAGTTTTGTATTTTAAATCGAGACGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTGGTCTTGGACTCCTGACCTCAAGTGATCCTCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGTGTGAACCACCGTGCCCAGCCTAAAGGGGTTTTAATTATCTGGTTTTGTAGGACTGGTTAGGAGAATGAGTTGTTGTTGTTGATGTTGTTTTTTAACCACACAGACCTTTCCAAATAAAAGATTCCAGTTGCATATGAAATATTAGATCACAAGTACAGTAAGTAATATTTCTCTAACATGTCATCCCTCTTGAAGGAGCTGTCTATAATGTGCTCCACTTCCTCAACACTGAGTCTCTTTTAGCCTGTATTAATTGGGGTCTTATCCCAACTATATAACTTAGGTTATTCTTACCAAGGGCACTGAAGGCCTTCATCTTTCCAAATCCGGTTGTCTATTTTCTGCCCTCCACTTGCTTGAAGTCTCAGCCGCCTTCAACTCAATTAACAATTCTCCCCATAAGTCACTTTTCTTTGGCTTTCCAGATGCATAGAAGTCTCCTCTGCCAGATCCTTCTCCTCTTGTCTGACCTCGAGATGACAAAATCTCCAGGGCTGAGTCATGGCCTTCTTAATTTCTCCATCTGTACCCTTTTTTAGGTGAGCTCAGATCTGACCTGTTTTTCTGAGCTGCAGACTTGTTTATCTAATTGTCTAATTGACATCCACTTGGATGTCTGATAGTTATCCCAGATCTAACATTGGCCAAATCGCTCTTTTTTCCCCCCAAATCTCCCTTGATTTCTCCTTTAAAACCCCCTTCTCAAAGCTATGCTCAAACTAAAATTCTTAGGAGTCATTCTAGATATTTCTTTTTGTTCTTACCCCACTTATTCCATCAGTTCTGTTCTTTCTTTAAAAAATAGTCTGAATCGGCCAGGCGTGGTCTCACGCCTGTAATCCTAGCAC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