Details for gene: BCR


A reciprocal translocation between chromosomes 22 and 9 produces the Philadelphia chromosome, which is often found in patients with chronic myelogenous leukemia. The chromosome 22 breakpoint for this translocation is located within the BCR gene. The translocation produces a fusion protein which is encoded by sequence from both BCR and ABL, the gene at the chromosome 9 breakpoint. Although the BCR-ABL fusion protein has been extensively studied, the function of the normal BCR gene product is not clear. The unregulated tyrosine kinase activity of BCR-ABL1 contributes to the immortality of leukaemic cells. The BCR protein has serine/threonine kinase activity and is a GTPase-activating protein for p21rac and other kinases. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene.[provided by RefSeq, Jan 2020]


Symbol
BCR
Name
BCR activator of RhoGEF and GTPase
Entrez ID
613
Ensembl ID
ENSG00000186716    (more details)
KEGG ID
hsa:613    (more details)
OMIM ID
613065
Uniprot ID
P11274  
GO ID
hsa:613    (more details)
Chromosome
22
Strand
1
Start
23179704
End
23318037
miRNA Interactions
hsa-miR-16-5p (RPM: 2473.4704) / hsa-miR-27a-3p (RPM: 980.3062) / hsa-miR-129-2-3p (RPM: 79.8688) / hsa-miR-194-5p (RPM: 48.9448) / hsa-miR-1304-3p (RPM: 12.7066) / hsa-miR-181b-3p (RPM: 2.493) / hsa-miR-197-3p (RPM: 347.3274) / hsa-miR-1343-3p (RPM: 3.6608) / hsa-miR-3202 (RPM: 0.0286) / hsa-miR-671-5p (RPM: 10.1036) / hsa-miR-4768-3p (RPM: 0.002) / hsa-miR-216b-5p (RPM: 11.7092) / hsa-miR-17-3p (RPM: 13.6088) / hsa-miR-96-3p (RPM: 0.9616) / hsa-miR-744-5p (RPM: 290.9362) / hsa-miR-27a-5p (RPM: 7.3838) / hsa-miR-4743-5p (RPM: 0.06) / hsa-miR-139-3p (RPM: 0.998) / hsa-miR-10a-5p (RPM: 408.7974) / hsa-miR-3141 (RPM: 0.2864) / hsa-miR-6781-5p (RPM: 0.0224) / hsa-miR-6877-5p (RPM: 0.209) / hsa-miR-6125 (RPM: 0.0416) /
Involved Diseases
retinoblastoma /
Involved Pathways
Pathways in cancer / Chronic myeloid leukemia / Disease / Diseases of signal transduction by growth factor receptors and second messengers / Signal Transduction / Signaling by Rho GTPases / Signaling by FGFR in disease / Signaling by FGFR1 in disease / FGFR1 mutant receptor activation / Signaling by cytosolic FGFR1 fusion mutants / Rho GTPase cycle /
Sequence
AACCCGTGTGGCAGCCACCCACAGCAGATCCACAACGTGAGAGGCCCGCTGAAACAAGGGTGCTGGCATTGGTTACTCAGCCTGGCCCTCCCTGCCTTGCGGGGTGACCTGCCTGGTCCTGGCCTCTCTGTGAGTTGGGCCCTGCTGGGTGGTCCCTAGTGTGCCCAGCCCTGAGGCTGGTGAGAGGCCAGGCTGTGAGGTGTGAGGAACTTACCTGCGTCTCCATGGAAGGTGCCCTCCGCATCGTTGGGCCAGATCTGCCTGGTCTTGCAGATGCCCACGATGGTGGCCTCTGACACGACGACTGGGCAGTGCCGGTGACGCTTATGGCACTGCGGCGTGGTAGGGGCAGAGGGGGGAGGTTGCTTCTGTCGGAGGACTGCTGCGAGTTCTGCCAGAGAGAGCAGCTCTTGTCCCGGAACATGAGGTAGGTGGTGGGGCTTGGGGACACGCGGCTGGACTGGCCGGAGAAGTCCTCCTGGCCGGAGGGGAGCCAAGTGTTCCTGTTCCAGGACTGCAGAACTGGCCCAGACCTCTGTATTGGAAAGGTCTTTATGGACCAGGGAGTCCGGTGTCTTTTTTACGGGGGACCCCTGGGCTGCGAGTTGCACAGTCCAATTCGCTGTTGTTAGGGCCTCAGTTTCCCAAAAGGCACAGGGACGGGGGGAGGGTGGCGGCTCGATGGGGGAGCCGCCTCCAGGGGGCCCCCCCGCCCTGTGCCCACGGCGCGGCCCCTTTAAGAGGCCCGCCTGGCTCCGTCATCCGCGCCGCGGCCACCTCCCCCCGGCCCTCCCCTTCCTGCGGCGCAGAGTGCGGGCCGGGCGGGAGTGCGGCGAGAGCCGGCTGGCTGAGCTTAGCGTCCGAGGAGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCACGGCGGCGGCGGGGCTGTGGGGCGGTGCGGAAGCGAGAGGCGAGGAGCGCGCGGGCCGTGGCCAGAGTCTGGCGGCGGCCTGGCGGAGCGGAGAGCAGCGCCCGCGCCTCGCCGTGCGGAGGAGCCCCGCACACAATAGCGGCGCGCGCAGCCCGCGCCCTTCCCCCCGGCGCGCCCCGCCCCGCGCGCCGAGCGCCCCGCTCCGCCTCACCTGCCACCAGGGAGTGGGCGGGCATTGTTCGCCGCCGCCGCCGCCGCGCGGGCCATGGGGGCCGCCCGGCGCCCGGGGCCGGGCTGGCGAGGCGCCGCGCCGCCGCTGAGACGGGCCCCGCGCGCAGCCCGGCGGCGCAGGTAAGGCCGGCCGCGCCATGGTGGACCCGGTGGGCTTCGCGGAGGCGTGGAAGGCGCAGTTCCCGGACTCAGAGCCCCCGCGCATGGAGCTGCGCTCAGTGGGCGACATCGAGCAGGAGCTGGAGCGCTGCAAGGCCTCCATTCGGCGCCTGGAGCAGGAGGTGAACCAGGAGCGCTTCCGCATGATCTACCTGCAGACGTTGCTGGCCAAGGAAAAGAAGAGCTATGACCGGCAGCGATGGGGCTTCCGGCGCGCGGCGCAGGCCCCCGACGGCGCCTCCGAGCCCCGAGCGTCCGCGTCGCGCCCGCAGCCAGCGCCCGCCGACGGAGCCGACCCGCCGCCCGCCGAGGAGCCCGAGGCCCGGCCCGACGGCGAGGGTTCTCCGGGTAAGGCCAGGCCCGGGACCGCCCGCAGGCCCGGGGCAGCCGCGTCGGGGGAACGGGACGACCGGGGACCCCCCGCCAGCGTGGCGGCGCTCAGGTCCAACTTCGAGCGGATCCGCAAGGGCCATGGCCAGCCCGGGGCGGACGCCGAGAAGCCCTTCTACGTGAACGTCGAGTTTCACCACGAGCGCGGCCTGGTGAAGGTCAACGACAAAGAGGTGTCGGACCGCATCAGCTCCCTGGGCAGCCAGGCCATGCAGATGGAGCGCAAAAAGTCCCAGCACGGCGCGGGCTCGAGCGTGGGGGATGCATCCAGGCCCCCTTACCGGGGACGCTCCTCGGAGAGCAGCTGCGGCGTCGACGGCGACTACGAGGACGCCGAGTTGAACCCCCGCTTCCTGAAGGACAACCTGATCGACGCCAATGGCGGTAGCAGGCCCCCTTGGCCGCCCCTGGAGTACCAGCCCTACCAGAGCATCTACGTCGGGGGCATGATGGAAGGGGAGGGCAAGGGCCCGCTCCTGCGCAGCCAGAGCACCTCTGAGCAGGAGAAGCGCCTTACCTGGCCCCGCAGGTCCTACTCCCCCCGGAGTTTTGAGGATTGCGGAGGCGGCTATACCCCGGACTGCAGCTCCAATGAGAACCTCACCTCCAGCGAGGAGGACTTCTCCTCTGGCCAGTCCAGCCGCGTGTCCCCAAGCCCCACCACCTACCGCATGTTCCGGGACAAAAGCCGCTCTCCCTCGCAGAACTCGCAACAGTCCTTCGACAGCAGCAGTCCCCCCACGCCGCAGTGCCATAAGCGGCACCGGCACTGCCCGGTTGTCGTGTCCGAGGCCACCATCGTGGGCGTCCGCAAGACCGGGCAGATCTGGCCCAACGATGGCGAGGGCGCCTTCCATGGAGACGCAGGTGAGTTCCTCACGCCACGTGCGTGGGCACACCTGCACGGGGGAGGAAAACCATAGACGAGTAGGGGATACAAAACAGAAGTTGGGAGGGAGGAGTGGATAGTTTTGAGTGTATCAGGTGCACTTGTGGTTCACGCGGATCCTGCACCCGAACAAACTCCATCCCCTCCTCCTTCCTGAATGCATACTGTTAGTGTTTGGAATGGAATTGGGTTGAGGATGGTCTTGTGAGGGATGGGAGGTGGTTTGTTCCTTTGGTTCTAGAGCAATGTGTTTGTGAAGTACAGCTTGTGAGTTGAAGGAAGATGCTTCAGGCAGTAACCTCCTTGCTATGTGCTCTCTCCATGCCGGGCAGTGAGGATGGCATAAAAGCCGGAGTCATCTCTAGCGCCCACATCGGATGCTGTTAGCAGGGACTGATTTATGTCTTGGGCATTCCCCGCCACCCCACTGATCCTGTTCTGGAGGGGTTATATGACACGTTTGTGAAACCTGAGATATGCTAGCTGCTCCTAGGCCATAGAAGTGTCAGGTTTGCTTGCTAACCAGCAGTCCTGAACACAAGTCACAGCAGGTGAGAATAGGAATTAGAAGGAAGTGAGGCGACAGGCAGTTGTGACTCAGTGGGCCACCGAAAATCAACTGCATGGAGATTTTATCTGGGGGTGAAGCAGAGCCACACCCGTTCTGATCTGCCTGGCTTTGATGGGAGGCTTCACCCATGATTATTCACCACCAGGCTCCTCCATGGTGGTAACCCAGCCCCATTTGCTGACCCTCCAGTGTGCTCCTGCTGCCTCATCTTGCCAAGGATAAGCACCCACAGGTGCTTATTTGGGGCTCCCAATCTGTGGTCAGATTCTAGCACTAAGATTAAAACTATGGGATTGTACGCCTAACTTCTGTGCTAGATGCAAATACCATCAGGCATTTTGGGTCATGGGACTATGTTTTGAGATCCAGACACAGTTTGCCATTGGGGTAAGGAAAGGGTGGGCTGGGGTGTGTGTGTGAGGCTGTCGGGAATCTTTTGGAGTCCTGGTCCCTGTTAAGCTCATCTGGTTTTCTGCTTCATTGATTTTTCTTTTTCTGCTGATGGAGGAGTTGAATGTGCTTGGTTTGTCAAAATCCTCTTCAAACGAGTGAGGCTATTTTTGGCTCTTAGAGCTGCTGCCTTTTTGTGGTGGGCACTCTGTCCTGTTTGTGTTAGGTACTTCCAGTTACTGATCTTCCATTTGCAGCTGGGGTTTCCTGTGGTGCACGGCTCCGACCTGCCGTCTGGCCGGGCTGCATTCCCTAAGTCCCTATGTGGGGGCGGGGTGGAAGGCTGTACTATTCAGAAGCCTGCTTTGCAGGCACATCAGCTCGTTCGGGGTCTGGAGGATTGCCTTGTGGTTACTGGGCACCAGCCTTGTCTGGCCAGCTGTTGGTCAGGCGAGCCAGCTTGAACTGGCCCTCAGTGCCATGGTGCAGGAGAGTTATTAATAAAGAAGAAAATGAGAGGTTTTTAGGGAGATGTGCAAATTGAAATTGATAGTCTTTGCTGGTGGAGAATTCTGGGTTTCCAGAACCTTGGGCCCAGCCTTTCCTACAGCTCCTGTAGACTTGGCCATGTTGGCCACATCACTAGACGCCGAATGCAAGTCAGTAAATGAATATAGGAATTATTATAGAGGGATGGAAAGCCCAGTGCCTTGAGTCAGACAGGGCAGGTCCTCAGGAAATGGCTGAGGAGGTAATTTTACCACTTGGACCCACTTTTAGGACTTGCTGGATTCTTCTCCGAATGTCCTCAAGGTCCCACAGTCTCTTTCCCATTAGGTTTTATTTTTTCCCCCTTAAATGTTTTGTTTGTTTTTTGTTTTTAAGAGACAGCGTCTGGCTCTGCCATCCAGGTTGGAATGCAGTAGTATGATCATAGCTCACTGCAACCTCAAAACTCTTGGGCTCAGGTGATCCACCACAGCCTTTTCAGCAGCTGGGACTGCAGGCTCAAACCACTATACTGGGCTAATTTTTAATTTTTTTTTTTTGTAAATACAGGGTCTTGCTGTGTTGCCCAGGCTGGTATCAAACTCCTGGGCTCAAGCATTCCTCTAGCTTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGGTTACAGGGATGAGACACCTCACCAGGCCTCTTAGACGTTTTTAGTAACTAAGGTCACTTAAACATTTTTAAAAGGGATTATTTTCCCTCAGACAGTTTTTCTTTTTTAAGACTTAATTTTTTTAGAGCTATTAGGTTCACAGCAAAATTGATCGGGAAATATAGCAATTTCCCACATACTCCCTACCCCTACACCCCCACAGCCTCCCCAGTTAACATCTCCCACCAGAGGGGCATGTTTGTTACAGTCCATGAACCTACCTGCATTGGTGCCTCATTATTACCCAAAGTCCAGAGTTTACATTTGGGTTCACTCTTGGTGTTGTACAGTCTATGAGTTTG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