Details for gene: SLC33A1


The protein encoded by this gene is required for the formation of O-acetylated (Ac) gangliosides. The encoded protein is predicted to contain 6 to 10 transmembrane domains, and a leucine zipper motif in transmembrane domain III. Defects in this gene have been reported to cause spastic paraplegia autosomal dominant type 42 (SPG42) in one Chinese family, but not in similar patients of European descent. Two transcript variants encoding the same protein have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2010]


Symbol
SLC33A1
Name
solute carrier family 33 member 1
Entrez ID
9197
Ensembl ID
ENSG00000169359    (more details)
KEGG ID
hsa:9197    (more details)
OMIM ID
614482
Uniprot ID
O00400  
GO ID
hsa:9197    (more details)
Chromosome
3
Strand
-1
Start
155821024
End
155854456
miRNA Interactions
hsa-miR-30a-5p (RPM: 15590.711) / hsa-miR-124-3p (RPM: 4110.4386) / hsa-miR-26a-5p (RPM: 45169.4864) / hsa-miR-4326 (RPM: 2.7166) / hsa-miR-92a-3p (RPM: 16961.15) / hsa-miR-4779 (RPM: 0.024) / hsa-miR-503-5p (RPM: 0.0972) / hsa-miR-92b-3p (RPM: 8345.0264) / hsa-miR-767-5p (RPM: 20.579) / hsa-let-7b-5p (RPM: 3396.2052) / hsa-let-7f-5p (RPM: 17066.6836) / hsa-miR-4695-5p (RPM: 0.009) / hsa-miR-150-5p (RPM: 64.1654) / hsa-miR-128-3p (RPM: 329.321) / hsa-miR-32-5p (RPM: 14.5562) / hsa-miR-548k (RPM: 8.758) / hsa-miR-455-3p (RPM: 82.7264) / hsa-miR-203a-3p (RPM: 1346.5646) / hsa-miR-766-3p (RPM: 5.2956) / hsa-miR-3129-3p (RPM: 0.2174) / hsa-miR-1-3p (RPM: 26.3428) / hsa-miR-24-3p (RPM: 581.6226) / hsa-miR-142-3p (RPM: 8.3404) / hsa-miR-23b-3p (RPM: 2125.0486) / hsa-miR-508-5p (RPM: 0.6) / hsa-miR-365a-5p (RPM: 0.6394) / hsa-miR-25-3p (RPM: 1063.0626) / hsa-miR-4284 (RPM: 0.1674) / hsa-miR-224-5p (RPM: 33.3102) / hsa-miR-365b-5p (RPM: 1.3016) / hsa-miR-651-5p (RPM: 2.417) / hsa-miR-146a-5p (RPM: 774.8698) / hsa-miR-155-5p (RPM: 106.9134) / hsa-miR-628-3p (RPM: 10.2162) / hsa-miR-324-3p (RPM: 32.0094) / hsa-miR-629-5p (RPM: 7.1172) / hsa-miR-363-3p (RPM: 298.497) / hsa-miR-335-5p (RPM: 265.7294) / hsa-miR-27a-5p (RPM: 7.3838) / hsa-miR-550a-3p (RPM: 2.5866) / hsa-miR-186-3p (RPM: 0.0884) / hsa-miR-3180-3p (RPM: 0.436) / hsa-miR-3199 (RPM: 0.1412) / hsa-miR-3145-5p (RPM: 0.2498) / hsa-miR-1262 (RPM: 1.6152) / hsa-miR-500a-3p (RPM: 426.0306) / hsa-miR-210-3p (RPM: 361.0562) / hsa-miR-6720-5p (RPM: 0.0746) / hsa-miR-153-5p (RPM: 0.2042) / hsa-miR-6778-3p (RPM: 0.0066) / hsa-miR-7977 (RPM: 18.3058) / hsa-miR-6849-3p (RPM: 0.0148) / hsa-miR-6857-3p (RPM: 0.0058) / hsa-miR-6747-3p (RPM: 0.3694) / hsa-miR-6736-5p (RPM: 0.0498) / hsa-miR-6516-5p (RPM: 0.859) / hsa-miR-6742-3p (RPM: 0.0278) / hsa-miR-6776-5p (RPM: 0.1206) / hsa-miR-383-3p (RPM: 0.0168) / hsa-miR-7109-3p (RPM: 0.042) / hsa-miR-6850-3p (RPM: 0.05) / hsa-miR-1908-3p (RPM: 3.7114) /
Involved Diseases
cataract /
Involved Pathways
Metabolic pathways / Glycosphingolipid biosynthesis - ganglio series / Transport of small molecules / Disease / SLC-mediated transmembrane transport / SLC transporter disorders / Disorders of transmembrane transporters / Transport of vitamins, nucleosides, and related molecules / Defective SLC33A1 causes spastic paraplegia 42 (SPG42) /
Sequence
ACTTCCTGAAGCGCGAGGCAGGAAGTTATATGCTTTTTCTGGAGTCCTGTAGAGAAAGTGCTCTCTGCCGCATTGATAGCAGCGAGAGCTGGAGGTGTTGGGTCGGGAGACCAGCCGTTCGATCCCGCCGCAGGTAGGAGCTGGTTTCCATCCTGGCACCACGGCACACACCTCCAGCCTCGAGCCCGGCGCTGCTGCCCGGGGGTCTCCTTCAGGCTCTTTGACGCCGTTCCAGGGGGCACCTATCCAGGCATCCTCTGGGCCTCTAGCCAGAGGACTGGCTCCCGGCTTCAGCACTCCGGGCTGCAGTAAGAAGTGCCCTTATCGCTCTGAGCCCTGCCACCATCCCGTGAACCACCGAAACCCTGGTCCAGCGCGACAGCCTTGGACCTGGGACTGGACGGATCCAAAACGCTCAGCCTCGGCCCCCCACAGACGGGGCTCTGCATCGTCTCTGATATGTCACCCACCATCTCCCACAAGGACAGCAGCCGGCAACGGCGGCCAGGGAATTTCAGTCACTCTCTGGATATGAAGAGCGGTCCCCTGCCGCCAGGCGGTTGGGATGACAGTCATTTGGACTCAGCGGGCCGGGAAGGGGACAGAGAAGCTCTTCTGGGGGATACCGGCACTGGCGACTTCTTAAAAGCCCCACAGAGCTTCCGGGCCGAACTAAGCAGCATTTTGCTACTACTCTTTCTTTACGTGCTTCAGGGTATTCCCCTGGGCTTGGCGGGAAGCATCCCACTCATTTTGCAAAGCAAAAATGTTAGCTATACAGACCAAGCTTTCTTCAGTTTTGTCTTTTGGCCCTTCAGTCTCAAATTACTCTGGGCCCCGTTGGTTGATGCGGTCTACGTTAAGAACTTCGGTCGTCGCAAATCTTGGCTTGTCCCGACACAGTATATACTAGGACTCTTCATGATCTATTTATCCACTCAGGTGGACCGTTTGCTTGGGAATACCGATGACAGAACACCCGACGTGATTGCTCTCACTGTGGCGTTCTTTTTGTTTGAATTCTTGGCCGCCACTCAGGACATTGCCGTCGATGGTTGGGCGTTAACTATGTTATCCAGGGAAAATGTGGGTTATGCTTCTACTTGCAATTCGGTGGGCCAAACAGCGGGTTACTTTTTGGGCAATGTTTTGTTTTTGGCCCTTGAATCTGCCGACTTTTGTAACAAATATTTGCGGTTTCAGCCTCAACCCAGAGGAATCGTTACTCTTTCAGGTAGTGTATTTAAGCTATTATGGTGTTAGGTTTATTTATCCTTTTGAAAGAGTGTGTGACGTTGGAGGGAAGCTCATTAATTTACTGGAAATCATTGTATGGGAGATAACTCAAGGTAAGTTTTCTGTTTCGTCCAAATGAGCTTCTTTGAAATATTAAAGCCAAAATGAATGATATTAGAGCAATCAAATGATCACTATGCGGTTAACAGGGAGAGGCAACCCATCAAATAACACAACCGAGTCCAGGGATTCATGCCACTTGCTTAATACACAAATGCACACTTTTAAAAAGTGTGGCTCATATGGTTCACATTTTTCCTTTTGTCTTGTTGGTTTTAGGTTTCTAGCTCTATACTTTCTAATCCATTTCTACCCCTACCGTTGTACCCAGAATCCAGCCTTCTAGTGAATGGAACAGGGTTTATTCGTTCAAACATTATTGAACCAGCTAAGGGACGGGATTCTAAGGCCTCTAATGAATAAGGCAGAGTTCTGCACTCAAGAAATAAGGAAGATGAACATTTTAGGAGAGTTCAGAGTTGCCAGTTAGTAACTGCCTTTGGGAGTCAGGCTTCACATTGCAGATAACATTTGACTTTGTTCTTGAATAAGATTCCACGAGGCCAGGAAATGGCACACCAGAATGCACAACACAAAGTAAAAGTGCACTGAGGCAGGAAAGTACAAAAAAGTACAGGACATTGCCTAAATTGTGGAACTGGGTTTGGGAAATCGTGCTGAGAAAGGCTGTGACTAAATTAGTAAGATTTTCTTTAATTACTATGGGAAAAGAGTTTAAAGTTTGTCCTGTAAGTAATGGAGGGTAAGTTCTAAAAAATTTCCCTGTTTCTCTGCATGAGTAAAACACATGTAAGTTTTTCTCTTTTTTCTTTTTTCTTCTTTTTTTTAATTGAGATAGTTGGGGGTCGGGGGGGCTGTCTCACTATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGGCCTCAGGTGATTCTCCCCCTCCTTGGCCTCCCAAAGTACTGGGAATTATAAGTGTGAACCACCCCACCTGGCCTAAGCTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTAACTTTTGTAACAACTAGAAAACAAGTAAAATGACCAATATCAGGAATAACAATGTCAGGAATATAGTGAAATTCTTCATTCTGTCAGTGATGATGAATTTAGGGGATTCTGTTTTGAAATTTAAGCAACTGAACTTCTCAGCTTCTGTGCTACCTTGGAAATTCACAGTAGAGTAAATGTCCAGGTATGTGGTGGTGGTAGGAGGTGTCACAACTACACTATTTTCCTGCAATCTTATTCTCACAGACATCTAACCTTATGTACACCTCCTCAAACTGCTAATGAGTGAGCCACTATTACTGGTGAAATGATGGTGATAGTACTTTTTCCTCAGTTGTTTGGTTGAGAGATAATTGCTTTGCACCCAGGTAGATTTGTCTCAGTGTTCTGGGGTTCCACTCCTGCTTTATGAATAATTCACTGCTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAGCATGGCGAAACCCCATTTTTGAGACTCTGTCTCAAAAATAAATAAATAAATAAAATAAAAAATAAGTCACGACTGGGCACAGTGGCTCACACCTGTTATCCCAGCACTTTGGGAGTCTGAGGTGGGAGGACTGCTTGAGCTGAGGAGGTAGAGCCAGCTTGGGCAATACAGCAAGACCTCATCTCTACTAAAAATTAAAAAAAAAAAAAAAATAGCTGGGTGTTTTGCGAAGGCCTGTAACCCTAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTCAGCCCGGGAGATTGTGGCTTCAGTGAGCTATGATCCAATCATTGCACCCCAGCCTGGTCAACAGAGTGCAACCCTGTCTTAAAATTATATATATGTATTTTTTATATGGAGTCTCCCTCTGACACTAGACTGGAGTGCAGTGGCAGGACCTCAGCTCACTGCGATTTCCACTTCTCTAGTTCAAGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGTGGGATTACAGGCATGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTACAGACAAGGTTTCACTGTGTTGGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGATCTTGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCGTAAGCCACTGCGCCCAGCCAAAATAAATTAATTAATTAAAAATAAAATTAAAATAAAGAAGTCAAGGCTGGTGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGACAGATCACCTGAGATCAGGAGTTTGAGACCAACCTGGCCAACATGGCAAAACCCCTTCTCTATTAAAAATACAAAAATTAGGTGGAAGTGGTGGCATTCACTTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGGGTGGGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAAGCAGAGGTTGCAGTGAACCGAGATCGCACCATTGCATTCCAGTCTAGGCGGCAGAGCAAGGCTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAGAATAAGTCAGTGTAAATTAAAATCCAGTGGCATAATTTTGATCCATTAGGGAACAGTTGTGGCTAAGGGAGTATAAATATAATAACTCTTGAACTCATAACATTATTCTCTGGAATGATGTTTTACCAATCACTCTTACATTAAGAGAAAGTTCCAATTTAGCTAATTAGCAATTTAGTTTCCATGGCCTCTTAAACCTTGATTTCACTGAGGCTTTCTCATCTTAAGTAACATCATCTCCTTAATCCTCTGTGGTGATATAAACAGCAGTCTCAGGACAAAATGAAAAGCAGACACATAAAAAGCAACAAACTGGCTGGGCGCGTTGGCTCACGCCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGAGGATCACAAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCCAACATGGTGAAACCTTGTCTCTTCTAAAAATACAAAAATTAGCCCGGTGTGATGGCATGCACCTGTAGTCTCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGGGAATCGCTTCAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGAAAGACTCCATCTCAAAAAAGAAAAAAGCAACAAACTGATAACAGACAGTATGCATTCACAGAGTATTTCTAGGCAGTGAATTGTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTCTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGGTAGAGTGCAGTGGTATGATCTCAGCTCACTGCAACTTCCCCCTCCAGGGCTCAAGCTATTCTGCTGCCTCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGATTATAAGCGTGTGCCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGATGGGGTTTCGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGTGATCTGCTCACCTCGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGTGCCTGGCTGTCACTTGTTATTTTGAATTGCCCCTTTTTTTTTTTTTCCTGTGGAATTTGAACTTTGTTCTGCAGTAGATTCTATAACTAGCTTACTTTTTAATTCAACTGTTTATATCTGTAGTGGACTGCTGTTTCTGGTTCAAACATTTTAGTTGAAAGTTAGAATTCCTATAGT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