Details for gene: GRIA4


Glutamate receptors are the predominant excitatory neurotransmitter receptors in the mammalian brain and are activated in a variety of normal neurophysiologic processes. These receptors are heteromeric protein complexes composed of multiple subunits, arranged to form ligand-gated ion channels. The classification of glutamate receptors is based on their activation by different pharmacologic agonists. The subunit encoded by this gene belongs to a family of AMPA (alpha-amino-3-hydroxy-5-methyl-4-isoxazole propionate)-sensitive glutamate receptors, and is subject to RNA editing (AGA->GGA; R->G). Alternative splicing of this gene results in transcript variants encoding different isoforms, which may vary in their signal transduction properties. Some haplotypes of this gene show a positive association with schizophrenia. [provided by RefSeq, Jul 2008]


Symbol
GRIA4
Name
glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 4
Entrez ID
2893
Ensembl ID
ENSG00000152578    (more details)
KEGG ID
hsa:2893    (more details)
OMIM ID
617864
Uniprot ID
Q1WWK6  
GO ID
hsa:2893    (more details)
Chromosome
11
Strand
1
Start
105609994
End
105982092
miRNA Interactions
hsa-miR-124-3p (RPM: 4110.4386) / hsa-miR-26a-5p (RPM: 45169.4864) / hsa-miR-27b-3p (RPM: 22876.2392) / hsa-miR-27a-3p (RPM: 980.3062) / hsa-miR-377-3p (RPM: 4.0398) / hsa-miR-135a-5p (RPM: 34.8504) / hsa-miR-579-3p (RPM: 0.0084) / hsa-miR-128-3p (RPM: 329.321) / hsa-miR-484 (RPM: 434.5276) / hsa-miR-373-3p (RPM: 0.0958) / hsa-miR-766-3p (RPM: 5.2956) / hsa-miR-27a-5p (RPM: 7.3838) /
Involved Diseases
myopia /
Involved Pathways
cAMP signaling pathway / Neuroactive ligand-receptor interaction / Huntington's disease / Amphetamine addiction / Circadian entrainment / Retrograde endocannabinoid signaling / Glutamatergic synapse / Dopaminergic synapse / Nicotine addiction / Transmission across Chemical Synapses / Neuronal System / Neurotransmitter receptors and postsynaptic signal transmission / Activation of AMPA receptors / Trafficking of AMPA receptors / Glutamate binding, activation of AMPA receptors and synaptic plasticity / Trafficking of GluR2-containing AMPA receptors / Unblocking of NMDA receptors, glutamate binding and activation / Activation of NMDA receptors and postsynaptic events / Protein-protein interactions at synapses / Synaptic adhesion-like molecules /
Sequence
AGGCTCTCCAGATTCCCGGGCTGTTTGCTGGTGAGAAATCTTTGCTGCAGCGAGGACCGGAGTCCCCCGCGCGCAGCCCAGTGGCAGAAGAGGGCTAGGCTGAGAGGGAAGCCAGGACTGTAGGAGAGGGAGGCAGCCCGTCCTCCTCACGAACCTGCAAGGATGCGGCAGGGGCCTGGGGGCATGGGGAGGTACTAACCCCCCGGAGCCCCCGATTGGGGCTTGCAGACCTGGCCCGTGGGCGGATTTTCTGCCTAGCGCAGCCGAGAAGCAGAGGTGCCAGGAAAACCAAGAGAGGGGCGCTGGGGGTGCCCATCCCCAGAGTCGGTCCCTCTGCGAACCGAGGAAGAAAAGAGGAGGGAGTCAGCGAGTGGTCAGAAGGGAAAACCTGACACCAGACTGGCTCCGGAGCGTCCGGGAGACTGGGGCGCTCCGGTGAGCACCCAGGGGGTGAAGCCAGCCGAGCGGTGGGCGAGGGGCGTGCGGAGGGAGTGCGCGCTCGAGGAGGGGACGCCAGGAGGGCAGCGATGCTCCGGGCTGGTGCAGGCTTGCTGGGGGATGTCGGCTGATGCGAGCTGGAGAGCGCGTGTGGCGGCCGCGGCGCCAGTGTTTGTGTGTATGTGAGAAAGCAAGGGGCGAGCGCGAGTGCGAGTGAGGCAAAGATAGAGCGCATGTCTCATCCCTGCGAGCAGCCACTAGACGCTCCACCACCATCTTTTGCATGTGCAACATTTGCAGCCGGACAGAAAACCTCTCCCAGGGCTATGGAGACTGCGGGAAAAATCTGGCGGCTCGCGATGGATTGCTAAGGAGAACTAGTCATAATCTTAAACCACCGAAACCTCTTTCCTTTTTTTTCTTTCTTTTCTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTTGATTTTAATTTTAGCGCCATCGTCTTCAATGCTTCTCTGAACAGCCTTTAGGAAGAGTGCGAGAGAAAGAGAGAGAGCGCGCGCCAGGGAGAGGAGAAAAGAAGATGAGGATTATTTCCAGACAGATTGTCTTGTTATTTTCTGGATTTTGGGGACTCGCCATGGGAGCCTTTCCGAGCAGCGTGCAAATAGGTAAGGTGTGCTCCGATGGGGTGTGCATGTGGCTGGTTGTAGCAGATATCCGAAAGTGAGTTAAATGAGTTGCTGATAAGCAATTCAGGGAAACCTTCAGCAGTTCCCTTCCCCTCTGTTTCCCTCCTCTTCCTTTCTCTCCTTTGCAAAAAGACTTCCTCTTTAGTGCAGGTTCCGTTGGAATACACCCAGGGCAGCCCACCCATGCGTTCTCAGCCCATAGCCCTATTTCCACCTTTACCTATAGTCGCTTAAGTAGGATTGAAATAAGTTGGGGGAAAGTCTTCGGGGAATTTGGTTGTATTTTATATGATATTTATTTCCATCCCTTTCTCTAAAGCATAAAGTGATGTCGAGTTTGTTTAAAAAAGAAAAAAAAAATCCACTTCTTCCCATTCTGGACGCCGCAGCTTTCTTGCTATTACAGAAAGACACTGTTTGAGGAAAAAGACATTTCCACCCGCACGCCCTGCCGTTTCTTGCTACCAGTTAGCAGATTCCAAAGTTAGATCCCTTTCCTGGAAGCTTCTCCCCTTTTATTTTGTTTTCTTCTTGAAGCTTTTGCCCTTATTTCTCTACCTCGACTCTGTTTCCAGGGACACCCTCCATCCTTGGCTTTTCTTGCTATTCTCCTCTACTGTCTTTTAATGGGACGCAGCTATTGAATTTCTTCCAGCTAAGCCCAGCCTCAACACTGCATCATTTCTCGTGGACTGTGCATAAAACGGAGTTAATTAGGCTGAGTCCACGAGCTGGAGGAAAATAAAGTTCATTTCTTCTTTCTGATTTCCCTCTTCCCTGTGTGGCACTATATCCCTTCATTTCCGTATTTTAATGTAAATCTCTTTTCCGCTCATCTGCATGCATCTTAGAGAGAGCTGCCCTGAGGTGGCTGATGTAGCAGTGTGCTGGGAATCAGGGGGAGGGCAAGGGAGAGAAAGGAACATTCACTAAATGGTCTCAGAGGTCATTGTGAGCAAGACACATTAGGACAAGAAAAAGCTGAGCTGCTCTAAAGACTAAATACTAAGCATGCACCTTAGGGACAAAGGGCAGTCTCCCTAGATGTGGCAGGTATAGCTCTTTAATTGTATGTGCTTGTGAATGGCAGTAGATTTGACTGTGCTTGGGGTGGGTATAATGTTGACAAGAGGAAACAGTGAATGTGCTTTTCCTGCTGTTTTTAATAGGTGGTCTCTTCATCCGAAACACAGATCAGGAATACACTGCTTTTCGATTAGCAATTTTTCTTCATAACACCAGCCCCAATGCGTCGGAAGCTCCTTTTAATTTGGTACCTCATGTGGACAACATTGAGACAGCCAACAGTTTTGCTGTAACAAACGCCTGTAAGTAAAACATAAGCTATGAAAAATTAGAAGAGAACTGAAACCAAGCAATGGAGTCCTCTTCCTCTTTGTTATTTAATTTTTTTAGAAAGAATTTCAAGATTCCCACAGTTGCCTGGTTTCAGGACAAATCAGAGTTAAAAACAAGACTTCGTTTCAGGGATATTTAGTTGTTTTTTTTTTCTTTTCCTTAATTTATTTTTCTTTTCTTTCTTCTCCTCCCTCTCTTTGCTTCTTCCTGACTTTCTCTTTTATTCATTATCTGTCTAGATCATTCAAGTTAAATTTTCCTTTAACATTTTAGTGTTATTCCTATCATCCGAATGTCAATTTAGTGAAAATTGTACTCAAGCTAGTTTTTTATTCTTTTCCTTTGGTTTTTCTTATTTGCTTTTCACTTGAGTAAGCATAGGTCTTGCTTTTAAAGAAGAAACATGAAGACTATGGAAGGCTTGCTAATAGTGAGAAAAAGAGGGGAGTGGTGGTGTGGAGGATATATATTTGAGTCGGTTGGTTGACGCTGCAGATGATCTGGTGATGTCACTTGAGGCTGCCCTGCCCTTATATTCTGGGGTGTAAATGTCTCTTACTATCACATAATGCATATATCCTGTGGATATAACTCCATGAATCCTTACCTCGATGCCAAATCACATTAGGCTCCCATCCACCTGAATTCACCAACCAACCCAGCTTTATCTATTATTCCACACAATGAAACTAAACGGGTGACCTCACCTAATGCCGTAAGAAAGCAGTTGTACAATTCCTCCCACTCTCACCAGGACACTGTATAACTTAATGTAAAAAAAAAATACAATCAACTGTGCATGTTAGTTTAAAACACATTGAAACATGATCAGTCAATAGCAGTTGTATTGCTTTTTCCTTCTGGAAGGAAGTGCATGTTTCAAATACCTCCTCACATTTATATGCTAATTTACCACTGTTTTAAATTCATAAATTCAGATAATGACTATAGATTATTTAAGAAGTAGGAATAGTTTCTACATACAATTTTGCATGTTTTCACAGTTAATAAAATGTTCAAGCTGAATTGTAAAGCCTTTTTGTCATATCAAGCTGGGAACATTTTTATTTAAAATTCTTTCAGTACAAGAAAGTGTGCTGAACAAAGAAACAAGTGAAATTGAAAACAGAGTTTTTAAATTTGTCTGGAGGACATCTGTTTCATCAACTTAAATTATTTAATTTGTATGTGTTGGCTGTTAATTCATATAGCAGATAACATGATAAAATTTTCTTAATTTTTGGTGTCTCTTTAACCGTTAATTCTTTTTAGAACTTAGTTTCATGAGGAGCTTGAAGCATATGTCACTTTTGCAAAGTGAATAATTATATTATTTTTCAGGAAGGCTATAGGTTCTATGAGTTACTACTTAATTTTTAAAAATCTCTTGACATATTTGGTGATAAAATCAATATTGCATTAAAGCAAAAGGGTGTTATTTTTATTCAGAAGTGCACATAAATTAGAACAAGGTTTGTGGGTAGTCCTTTTTGTAAAATTTCTCAGTTAATAGTTTTATGTTCCAAGTTTTAAAAGGGATGTCAGCATTCTAAGTAGTTCTAAGGAAAGCATTCTTTTTAATACGTAAATATTATTTGTTTATTTAAATATTTTTCTCATGTCTCTCCTAAGATTCTGTCAATCTTACTACTTTTAAAAATAATCTATGATCCAAATACATGTGAAGGTACTTTATCAATAGTAATTATTTTAACATATTAATTATTATTATTAAATTTTGAAAGATTTCCTTACAAGTGGCAGATATATGTTTTATTTTGTTTCATTTTTACAAAGTAAGATCTTAAATATTCTAAAGTTTGTATTGTGACTTCCAGTAATGTAAACTATATGAGGCTAATCCTCTTTTCCTCCTTTTTGTTTGTTAACCTCATTTGGGATAACTGTAACTAGTATTATTTTATTTATGTAATAAAAATATATGTGAAATAAAGTGTTACTGGTAAAGTACTTGTAAACATGATAAATATTAGCAAGTTGCATACAGAATTAAAAAGTAGAAAAAAATATGAAACGTAGAGTATGTTATTCCTTAACATATAAGGATTGAGAAAATTGACACGAGTAAACTTTAAGTCTGTTTATTTAGAATCCAAGAATAATACAGTATTAGTGATCTAATATTTGTTATAATCACATACAATTGATTTTGCGTATGTTTAAAAATTTTTTAAGAAAACAAATTGTAAATAAGGAGAGAACATTTTCTAGCAGAGAAAAGGAAAGTTATTTTGACAAATGAGCATGCTGAAAATCCTTAAGGCAAATCTAAGCAGAATTTGGGAAAAAATCAATAGTCAAGAGTGTGGGTCAGGTGATTGGTGTTTGTTGAATGGACTGACCGAGAGCATACAGACTCGTGATTTTCCAATCTAATTAAAGGTAAAACGTAAGCAGTAAATATAAGGCAACCTCATTTATCAAGCTCTATGCCTTTGAGTACAAAAGGGTAAAAATAGGTCTTGAAATTTAATATTCTAGATAATTAACATGAAACTTATTCCTCA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